كان التعاون الاقتصادي يغذي العلاقة بين تركيا وإسرائيل في الغالب. نظرًا لكون إسرائيل واحدة من أكثر الدول تقدمًا من الناحية التكنولوجية في العالم ولدى تركيا ثاني أكبر اقتصاد في الشرق الأوسط بعد المملكة العربية السعودية، فإن هاتين الدولتين لديهما بعض من أكثر الاقتصادات تقدمًا في المنطقة. تركيا هي عاشر أكبر شريك اقتصادي لإسرائيل، بينما إسرائيل هي ثامن أكبر شريك تجاري لتركيا، مما يشير إلى وجود صلة تجارية كبيرة بين البلدين. كما قدمت إسرائيل مساهمات مالية كبيرة للاقتصاد التركي، لا سيما في مجالي البناء والعقارات.
كان التعاون العسكري عنصرًا مهمًا في علاقة تركيا وإسرائيل. بدأت تركيا وإسرائيل العمل معًا في القضايا العسكرية في التسعينيات، حيث زودت إسرائيل تركيا بأحدث التقنيات العسكرية ومنحت تركيا إسرائيل الوصول إلى مجالها الجوي لإجراء التدريبات العسكرية. كان الدافع وراء تعاونهم هو القلق المشترك بشأن نفوذ إيران المتزايد والخطر الذي تشكله المنظمات الإسلامية المتطرفة مثل حماس وحزب الله. لكن بسبب تدهور العلاقات بين البلدين، انخفض هذا التعاون مؤخرًا.